Modelling merupakan sebuah cara untuk memperoleh pendekatan matematis yang cukup merepresentasikan proyek tim iGEM.

 

Modelling dapat digunakan untuk :

1. Memprediksi tingkat ekspresi protein yang diinginkan dari suatu sistem biologis

2. Memperkiraan biaya produksi sesuai proses yang digunakan

3. Membuat perbandingan efektivitas biaya terhadap metode sintesis kimiawi

4. Analisis ketidakpastian suatu reaksi biokimia

5. Memperkirakan struktur protein

 

Modelling biasanya didasarkan pada pendekatan komputasional untuk mempelajari serta memahami proses biologis dan biokimiawi di berbagai tingkatan, dengan melibatkan berbagai disiplin ilmu termasuk biologi, biofisika, dan statistika.

 

Umumnya modelling biokimia digunakan untuk analisis molecular docking, desain obat, protein, dan rekayasa enzim. Perangkat lunak yang biasa digunakan untuk modelling antara lain Autodock (memperkirakan interaksi protein), Simbiology (simulasi sistem biologis sintetik), GenoCAD (desain konstruksi genetik), dan Phyre (perangkat online untuk memperkirakan struktur protein).